As amputações congénitas são geralmente realizadas em crianças e adultos jovens.
Estas cirurgias devem ser realizadas o mais tarde possível, à espera que o indivíduo amadureça para participar na decisão (Downie, 1983). A sua causa é frequentemene desconhecida.
A droga talidomida, a qual foi utilizada por gestantes no final da década de 1950 e no início da década de 1960 contra o enjoo matinal, foi retirada do mercado após ter sido identificada como causadora deste tipo de defeito.
A talidomida causava a formação de apêndices semelhantes aos membros de uma foca (focomelia) no lugar dos membros superiores e inferiores.
As crianças geralmente acostumam-se com facilidade a utilizar o membro malformado e uma prótese pode ser criada para torná-lo mais funcional.